蓝耳病在临床上单一出现的几率不高，多是混合感染的机会比较多，所以解剖病变也比较复杂；不是蓝耳病的猪只同时都会出现以下的解剖病变，出现以下的几种病变都不能排除蓝耳病的可能性：
　　1心肌出血，有乳白色纤维素状渗出物，心冠状沟脂肪及心内外膜有出血点。
　　
　2肝脏肿胀、颜色变浅，有些肝呈土黄色、质脆，有些猪肾、膀胱、喉头等有出学点

　　3脾脏肿大、质脆、严重时坏死。
　　
　　4肺脏肿胀、变硬，呈橡皮状，肺脏间质增宽，肺部呈现斑驳状到褐色病变。
　　
　　5肾脏肿大、颜色变浅、呈褐色或土黄色、质地较脆，有淤血现象。
　　
　　6胃粘膜有出血点，有的胃大弯粘膜弥漫性出血，严重时出现溃疡。
　　
　　7全身淋巴结肿大，有多发性、浆液性、纤维素性胸膜炎和腹膜炎，胸腔及腹腔有纤维蛋白的渗出；个别严重猪肺脏浆膜与胸膜呈心包纤维素性粘连。